Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b4Q99ME6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms