Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprtQ99M80 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprtQ99M80 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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