Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fars2Q99M01 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fars2Q99M01 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms