Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms