Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnpo2Q99LG2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms