Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms