Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lysmd3Q99LE3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lysmd3Q99LE3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms