Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pagr1aQ99L02 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pagr1aQ99L02 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms