Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf19Q99KP6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms