Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms