Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Reep3Q99KK1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms