Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlgn1Q99K10 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms