Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims1Q99JW4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms