Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spef1Q99JL1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spef1Q99JL1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms