Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms