Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Smim11aQ99J19 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Smim11aQ99J19 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Smim11aQ99J19 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Smim11aQ99J19 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Smim11aQ99J19 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Smim11aQ99J19 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim11aQ99J19 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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