Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnf112Q96DY5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf112Q96DY5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms