Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf144aQ925F3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf144aQ925F3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms