Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Lmo1Q924W9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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