Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alpk3Q924C5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alpk3Q924C5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alpk3Q924C5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alpk3Q924C5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms