Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gtpbp3Q923K4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gtpbp3Q923K4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gtpbp3Q923K4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gtpbp3Q923K4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtpbp3Q923K4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gtpbp3Q923K4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtpbp3Q923K4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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