Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sirt1Q923E4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sirt1Q923E4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms