Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf3b5Q923D4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sf3b5Q923D4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sf3b5Q923D4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sf3b5Q923D4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sf3b5Q923D4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sf3b5Q923D4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sf3b5Q923D4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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