Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf3Q920N1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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