Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms