Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Pde6cQ91ZQ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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