Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms