Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atpaf2Q91YY4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atpaf2Q91YY4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atpaf2Q91YY4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atpaf2Q91YY4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atpaf2Q91YY4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atpaf2Q91YY4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms