Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm2Q91YD4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms