Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usb1Q91W78 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms