Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csde1Q91W50 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csde1Q91W50 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms