Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc3Q91W40 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms