Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms