Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NifkQ91VE6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms