Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelenomQ8VHC3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms