Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps4aQ8VEJ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms