Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc115Q8VE99 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc115Q8VE99 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc115Q8VE99 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc115Q8VE99 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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