Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cul7Q8VE73 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul7Q8VE73 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms