Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Smg8Q8VE18 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Smg8Q8VE18 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Smg8Q8VE18 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Smg8Q8VE18 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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