Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1aQ8VDS4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1aQ8VDS4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms