Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sft2d2Q8VD57 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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