Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef3Q8VCC8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef3Q8VCC8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms