Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms