Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms