Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc12Q8R344 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms