Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf183Q8QZS5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf183Q8QZS5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf183Q8QZS5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf183Q8QZS5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf183Q8QZS5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf183Q8QZS5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf183Q8QZS5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf183Q8QZS5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf183Q8QZS5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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