Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Colec12Q8K4Q8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms