Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltbp4Q8K4G1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltbp4Q8K4G1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp4Q8K4G1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp4Q8K4G1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp4Q8K4G1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp4Q8K4G1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp4Q8K4G1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp4Q8K4G1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltbp4Q8K4G1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms