Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolbQ8K409 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms