Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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